一、首重宇宙的周期性

元运是玄空学的灵魂，其推地运以20年为一运，三运60年为一元，180年为三元。故又称为“三元玄空地理”。

玄空学认为地运是有周期性的，即地表上的山水、方位是不变的，而往来于天地间的气却是变化的。例如，某地的北面有一座山，40年来其外形一直没有改变。这对于普通人来说，40年前后的此山都是一样：山就是山，还位于北面。但在学过玄空学的人眼中，40年前与后的此山，“气运”却大为不同：虽然形体和方位依旧，但“气运”却因为周期性而发生了很大的变化。

二、收山、收水方法特别

玄空学不但注重“气运”的变化，而且更重视如何收取宇宙间的生旺元气！它以星数及排“洛书九宫”的方法去推算：每局按坐向及入极元运先排出挨星盘，来分析其变动之气，宜将挨得向星的旺、生气排到“水”里或气口（阳宅开门要开在向星的旺、生气方），退、死、煞气要排到“山”；宜将山星的旺、生气排到“山”，退、死、煞气要排到“水”；这样才为“收得山来，出得煞去”。

三、以挨星组合论意象

玄空学运用九宫挨星法，以分辨周围山水及房屋各个宫位的旺衰，并以山向挨星的组合，从卦意卦象推究人生百态，论断“财、丁、贵、秀、贤、愚、疾病、房分”等十分准验，其学理精深至微。

四、分金方法不同

目前流行的120分金，是指每“山”分作5格，“二十四山”共有120格分金。玄空学将每“山”中间三格范围内的称为“下卦”，最左、右一格称为“替卦”或“起星”。在用法上，“下卦”和“替卦”的差别很大，这也是玄空学不同于其他门派很特殊的创举。

五、罗经用法不同

一般罗经有“三盘”：正针“地盘”（内圈）、中针“人盘”（中圈）、缝针“天盘”（外圈）三合派以正针格龙、立向，中针消砂，缝针纳水；也有些人竟用中针或缝针来立向。而以玄空学看阳、阴宅，不管是立向、消砂、纳水，一律都用正针。

六、独具许多理气奥秘

例如：对“反、伏吟”的解释，玄空学将当山向挨星与“元旦盘”相同时，称为“伏吟”；相反时称为“反吟”。“反、伏吟”当令时尚可，失令时则发祸猛烈，这现象也只有玄空理气才能做出解释。此外，玄空学还有许多断验如神的理气奥秘，而其他门派则没有。